Епидемия от ротавирус от група C в начално училище в Луджоу, Китай, и технологията за секвениране на целия геном на Macro & Micro-Test позволява прецизно проследяване на източника.

Наскоро,Седмично издание на CDC за Китайпубликува важна научна статия, описваща епидемиологичното и етиологично разследване на огнище на остър гастроентерит, причинено от ротавирус от група C (RVC) в начално училище в Луджоу, провинция Съчуан, през октомври 2025 г. Важно е да се отбележи, че високопроизводителният комплект за целенасочено улавяне на патогени (улавяне със сонда) на Macro & Micro-Test и технологията за секвениране на обогатяване на целия геном изиграха ключова роля в разследването. Като позволи точна идентификация на патогените и цялостна геномна характеристика, технологията предостави критични научни доказателства за бързо потвърждаване на огнището, прецизно проследяване на източника и ефективен контрол на огнищата.

Макро микро тест

Внезапно огнище: Първо съобщено огнище на RVC в Югозападен Китай

На 15 октомври 2025 г. в начално училище в Луджоу възникна остра епидемия от гастроентерит. Училището имаше общо 1943 ученици и служители, с 32 регистрирани случая, включително 6 лабораторно потвърдени и 26 клинично диагностицирани случая, което доведе до общ процент на заболеваемост от 1,65%. Пикът на епидемията достигна между 15 и 16 октомври, като най-висок процент на заболеваемост беше в 7 клас и 5 клас (23,08%). Повечето пациенти бяха деца в училищна възраст (средна възраст: 10 години), като се проявиха предимно с повръщане (65,62%), диария (46,87%) и коремна болка (37,50%). Симптомите обикновено продължиха 1–3 дни и всички пациенти се възстановиха без тежки усложнения.

Първият докладван RVC

Епидемиологичното разследване идентифицира индексния случай като 11-годишно момче в 7. клас, 5. По-малката му сестра е развила подобни симптоми преди него, което предполага битово предаване като първоначален източник. Неадекватното управление на повърнатите материали в кампуса – включително директно метене и изхвърляне без навременна дезинфекция или изолиране на зоната – в съчетание с лоша хигиена на ръцете сред учениците, вероятно е улеснило по-нататъшното предаване. Повечето засегнати класни стаи са били разположени между втория и петия етаж и са споделяли съседни мъжки тоалетни, което показва, че както аерозолното, така и контактното предаване може да са допринесли за разпространението.

Разследването стана особено трудно, тъй като рутинният скрининг за патогени, включително тестове за норовирус и ротавирус от група А, даде отрицателни резултати, което показва, че причината е рядък патоген.

Етиологична диагноза: Секвенирането на целия геном на макро и микро-тест идентифицира виновника

Първоначалният тест за норовирус е бил отрицателен. Впоследствие CDC в Луджоу използва мултиплексен PCR анализ в реално време за стомашно-чревни патогени, способен едновременно да открие 28 патогена, включително 8 вируса, 17 бактерии и 3 паразита, за да скринира осем клинични проби. На 17 октомври шест проби са дали положителен резултат за ротавирус от група C, като успешно са идентифицирали причинителя.

За да проследят по-нататък източника на епидемията, изследователите извършиха както нанопорно метагеномно секвениране, така и секвениране с улавяне на сонди за обогатяване на целия геном на Macro & Micro-Test върху пет положителни проби. Този подход успешно генерира пет пълни геномни секвенции на RVC (SC01–SC05). Интегрираната стратегия за бърз мултиплексен PCR скрининг, последван от секвениране на целия геном с висока резолюция, осигури стабилна техническа подкрепа за точна молекулярна епидемиология и проследяване на източниците.

Научни прозрения: Първа идентификация на генотипа M2 в Югозападен Китай

Въз основа на висококачествените данни за целия геном, генерирани с помощта на технологията на Macro & Micro-Test, изследователският екип докладва няколко важни научни открития:

Потвърждение на моноклонално огнище:И петте вирусни изолата споделяха идентичен генотип на целия геном (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), само с 0–1 разлики в еднонуклеотидния полиморфизъм (SNP), което убедително демонстрира, че епидемията е възникнала от една единствена верига на предаване.

Откриване на генотипа M2:Филогенетичният анализ разкри, че щамовете Luzhou RVC принадлежат към генотип M2, а не към генотип M3, считан преди това за преобладаващ сред китайските щамове RVC. Това откритие оспорва конвенционалното разбиране за разпределението на генотипа RVC в Китай и потвърждава появата на генотип M2 в югозападен Китай.

Доказателства за международни преносни връзки:Сравнението на целия геном показа високо генетично сходство между щамовете Luzhou и щамовете RVC, докладвани по-рано в Юнан (2025), Новосибирск, Русия (2017) и Италия (2012), което предполага съществуването на активна евразийска преносна мрежа.

 

Доказателства за международни преносни връзки

Последици за превенцията и контрола: Ранното откриване и бързата намеса са от съществено значение

След идентифицирането на патогена, CDC в Луджоу незабавно въведе всеобхватни мерки за контрол, включително изолиране на случаите, дезинфекция на околната среда, стандартизирано управление на повръщаното и временно спиране на курсовете. Огнището беше успешно овладяно в рамките на един инкубационен период, без да са регистрирани допълнителни случаи след 21 октомври.

Разследването предоставя и важен урок за общественото здраве: при клъстерни огнища на гастроентерит, които са отрицателни както за ротавирус от група А, така и за норовирус, ротавирус от група C и други ротавируси, които не са от група А, трябва да бъдат включени в рутинния диагностичен скрининг.

Това проучване представлява първото докладвано огнище на ротавирус от група C в югозападен Китай и първото идентифициране на генотипа M2 в региона, разширявайки настоящото разбиране за епидемиологията на ротавируса от група C в Източна Азия. В това изследване, интегрираното решение на Macro & Micro-Test, комбиниращо мултиплексен PCR скрининг със секвениране за обогатяване на целия геном, демонстрира значителна практическа стойност, като позволи както бърза идентификация на патогените, така и проследяване на молекулярния източник с висока резолюция, осигурявайки възпроизводима техническа рамка за прецизно изследване и контрол на бъдещи огнища на инфекциозни заболявания.

 


Време на публикуване: 30 юли 2026 г.