Скорошно метагеномно проучване разкри забележително разнообразен спектър от вируси и бактерии, пренасяни от гризачи в провинция Хейлундзян, включително вируса Ласа, вируса Амур, салмонела и Yersinia pestis.
В изследването са използваниКомплект за обогатяване на патогенна РНК от Macro & Micro-Test, базирана на технология за улавяне на сонди. Чрез селективно изчерпване на рРНК на гостоприемника и други запазени фрагменти от гостоприемника, методът ефективно задържа микробната РНК, значително подобрявайки чувствителността при откриване на патогени. Тази стъпка на обогатяване на патогенна РНК беше от решаващо значение за постигане на висок процент на откриване и осигури силна техническа подкрепа за наблюдение на патогени.
Гризачи: ключови резервоари на зоонозни заболявания
Гризачите са най-богатата на видове и широко разпространена група бозайници, обхващаща повече от 2000 вида по целия свят и представляваща над 40% от всички видове бозайници.
Освен екологичното си значение, гризачите служат като основни резервоари и вектори на множество зоонозни патогени.Тъй като местообитанията на гризачите често се припокриват с човешката среда – чрез директни ухапвания, контакт с екскременти или непряко предаване чрез бълхи и акари – патогените, които те приютяват, представляват постоянна заплаха за общественото здраве.
Забележително е, че повече от 70% от нововъзникващите инфекциозни заболявания произхождат от дивата природа, като гризачите представляват един от най-значимите резервоари на вируса.
Граничен регион Хейлундзян: фронтова линия за наблюдение на патогени
Хейлундзян, гранична провинция в североизточен Китай, притежава изобилие от екологични ресурси и граничи с множество държави. Комбинацията от богато биоразнообразие и честото трансгранично движение на населението създава благоприятни условия за предаване на патогени.
Между юни и юли 2021 г. изследователи събраха 67 диви гризачи от град Хенгдаохедзъ, град Мудандзян. Пробите включват:
л 20Полуостров Аподем
л 47Миодес руфоканус
Всички екземпляри са уловени в жилищни райони и околни земеделски земи, което подчертава тясната връзка между човешките селища и местообитанията на дивата природа.
Технология за обогатяване на патогени: Преодоляване на фоновата интерференция на гостоприемника
При метагеномното секвениране, гостоприемната РНК обикновено доминира в секвениращите отчитания, маскирайки сигналите за патогени с ниско съдържание на патогени.
За да се справи с това предизвикателство, в проучването е използваноКомплект за откриване на патогени чрез метагеномни методи на Macro & Micro-Test. Използвайки технология за улавяне на сонди, специално разработените сонди се свързват с рРНК на гостоприемника и консервираните последователности, което позволява тяхното изчерпване и по този начин обогатяване на микробната РНК.
Този подход значително подобри чувствителността на откриване на патогени, позволявайки последващо секвениране да възстанови по-голям дял от показанията на патогените. Етапът на обогатяване постави солидна основа за точно характеризиране на патогенния спектър, пренасян от гризачите.
След обогатяване, РНК пробите претърпяха обратна транскрипция, изграждане на библиотека и високопроизводително секвениране. Биоинформатическият анализ включваше:
Филтриране на генома на гостоприемника
l Таксономична класификация с помощта на Kraken2
l Корекция на изобилието с Bracken
Този работен процес генерира подробен профил на вирусни и бактериални общности.
Резултати от изследването: Съвместна циркулация на множество вируси и бактерии
Вирусни находки
Откритите вируси принадлежат към 21 вирусни семейства, включителноАренавиридииХантавириди.
Чрезде новоЧрез сглобяване с помощта на Megahit бяха генерирани 154 вирусни контига, от които 110 съвпадаха с 19 вируса от осем семейства.
In Полуостров Аподем, бяха идентифицирани следните вируси:
l Аренавируси: Lassa вирус, Wenzhou вирус, Gairo вирус
l Хантавируси: Amur вирус, Puumala вирус
In Миодес руфоканус, бяха открити плъши артеривирус и амурски вирус.
Сред тези патогени:
Вирусът Ласа е причинител на вирусна хеморагична треска, като смъртността достига приблизително 20%.
Амурският вирус е един от патогените, отговорни за хеморагичната треска с бъбречен синдром (HFRS). Китай отчита най-високата световна тежест на инфекциите с хантавирус.
Бактериални находки
Анотирани са общо 1051 бактериални рода.
Най-многобройните родове бяха:
лСалмонела(26–31%)
лЙерсиния(11–23%)
Салмонелае основен хранителен патоген, отговорен за приблизително 9 милиона случая на коремен тиф и приблизително 110 000 смъртни случая годишно в световен мащаб.
Йерсиния пестис, причинителят на чума, е отговорен за три исторически пандемии. Провинция Хейлундзян е призната за едно от естествените огнища на чума в Китай и остава приоритетен регион за наблюдение на чумата.
Значение на изследването
Научни приноси
Това проучване представлява първият доклад за фрагменти от вируса Lassa и вируса на артериит при плъхове при гризачи от Хейлундзян, разширявайки базата данни за патогени, пренасяни от гризачи, в Китай.
Той систематично характеризира вирусните и бактериалните съобщества в местните популации на гризачи, предоставяйки базови данни за наблюдение на зоонозните заболявания в граничните райони.
Последици за общественото здраве
Констатациите подчертават необходимостта от непрекъснато наблюдение и скрининг на патогениA. peninsulaeиМ. руфоканус.
Данните предоставят научни доказателства в подкрепа на стратегиите за контрол на източниците на заболявания като чума и хеморагична треска с бъбречен синдром.
Методологични силни страни
Метагеномното секвениране позволява безпристрастно откриване както на известни, така и на нови патогени.
В това проучване, технологията за обогатяване на патогени на Macro & Micro-Test демонстрира силна производителност, като ефективно подобрява откриването на целеви патогени в сложни биологични проби. Резултатите потвърждават способността ѝ да подпомага високочувствителното идентифициране на патогени при наблюдение на дивата природа.
Препоръка за продукт
Въз основа на успешното му приложение в това проучване, комплектът за обогатяване на патогенна РНК на макро и микро тестове е силно препоръчителен за метагеномни изследвания за наблюдение.
Чрез ефикасно изчерпване на нуклеиновите киселини на гостоприемника и обогатяване на микробните последователности, комплектът значително подобрява чувствителността на откриване и качеството на данните. Той представлява основен инструмент за точно откриване на патогени в сложни проби и осигурява стабилна техническа поддръжка за наблюдение на общественото здраве, оценка на зоонозния риск и готовност за огнища.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Време на публикуване: 02 март 2026 г.