Неотдавнашно проучване, публикувано вМикробиомпроведоха вирусен метагеномен анализ на 846 диви дребни бозайници, включително прилепи, гризачи и землеровки, събрани в Сиера Леоне, Западна Африка. Проучването идентифицира общо 39 РНК вируса, свързани с бозайници, включително 26 нови и 13 известни преди това вируса. Сред тях семейство Paramyxoviridae показва най-голямо разнообразие, докато гризачите съдържат най-голям брой вирусни видове (n = 26).
Оценката на зоонозния риск разкри три известни зоонозни вируса – вирус на енцефаломиокардит, вирус Lassa и Rocahepevirus sp. – както и три вируса с потенциален риск от разпространение: Melian вирус, вирус на хепатит при гризачи и Hunnivirus A. Забележително е, че сред новоидентифицираните вируси, Bat ledantevirus 2 показа най-близка филогенетична връзка с вируса Le Dantec, който заразява хората. Серологичният анализ допълнително откри неутрализиращи антитела срещу този вирус при 2,8% от местните жители, което предполага предишно, вероятно неоткрито, излагане на хора.
Тези открития подчертават наличието на значителен резервоар за вируси, доминиран от гризачи, в Западна Африка и подчертават критичното значение на интегрираните стратегии за наблюдение на интерфейса човек-животно. Комбинирането на метагеномен скрининг със серологична валидация осигурява надеждна рамка за идентифициране на вируси със зоонотичен и преносим потенциал.
През последното десетилетие повече от 60% от нововъзникващите инфекциозни заболявания при хората са с произход от животни, като прилепите, гризачите и землеровките са признати за ключови гостоприемници на зоонозните вируси. Африка е широко разглеждана като гореща точка на зоонозни заболявания. Например, Сиера Леоне е съобщила за над 28 000 случая по време на епидемията от ебола през 2014-2016 г.
Въпреки значителната тежест на зоонозните заболявания в този регион, разнообразието и разпространението на вирусите при дивите дребни бозайници остават недостатъчно характеризирани. За да се справи с тази празнина, изследователите проведоха систематичен анализ на вирома на 846 диви дребни бозайници, уловени на три места в Сиера Леоне между 2018 и 2023 г. Изследването имаше за цел да характеризира вирусното разнообразие, да идентифицира кандидати с потенциал за междувидово предаване, да оцени зоонотичния риск и да генерира доказателства в подкрепа на системите за ранно предупреждение за нововъзникващи инфекциозни заболявания.
Основни методи
В проучването е приложен цялостен работен процес за вирусна метагеномика:
- Обработка на проби:Тъкани от сърце, черен дроб, далак, бял дроб и бъбреци бяха събрани, обединени, хомогенизирани и подложени на екстракция на тотална РНК.
- Секвениране и сглобяване:Изчерпването на рибозомната РНК е извършено преди изграждането на библиотеката, последвано от високопроизводително секвениране, използвайки платформата Illumina NovaSeq 6000. Вирусните контиги са сглобени de novo.
- Идентификация на вируса:Вирусите бяха идентифицирани въз основа на подравняването на гените на РНК-зависимата РНК полимераза (RdRp). Запазени бяха само вируси, свързани с гръбначни, с изключение на бактериални, гъбични и растителни вируси.
- Биоинформатичен анализ:Проведени са филогенетична реконструкция, рекомбинационен анализ, моделиране на междувидови предавателни мрежи и оценка на зоонозния риск.
- Серологична валидация:Разработен е VSV-базиран псевдовирусен неутрализационен тест за Bat ledantevirus 2. Неутрализиращи антитела са открити в 2,8% от човешките серуми, което предоставя доказателства за потенциално зоонотично предаване.
ПроучванеРезултати
1. Откриване и разнообразие на вируси
Това проучване е провело транскриптомен секвениращ анализ на 846 диви животни, събрани в Сиера Леоне, включително гризачи, прилепи и землеровки. Въз основа на пълните генни секвенции на РНК-зависимата РНК полимераза (RdRp) са идентифицирани общо 39 РНК вируса, свързани с бозайници, включително 13 известни преди това вируса и 26 нови вируса.
По отношение на вирусния състав, семейство Paramyxoviridae показва най-високо ниво на разнообразие и в трите разреда гостоприемници, следвано от Astroviridae и Picornaviridae. По отношение на разпределението на гостоприемниците, гризачите допринасят с най-голямо вирусно разнообразие, като съдържат общо 26 вирусни вида, което показва тяхната важна роля като резервоари на вирусно разнообразие в региона.
2. Зоонотичен риск
Оценката на зоонозния риск идентифицира три известни зоонозни вируса: вирус на енцефаломиокардит, вирус Lassa и видове Rocahepevirus. Освен това, три вируса – Melian вирус, вирус на хепатит при гризачи и Hunnivirus A – бяха идентифицирани като имащи потенциален риск от разпространение.
Сред 26-те новооткрити вируса, за четири се прогнозира висок зоонотичен потенциал, въз основа на филогенетични и геномни характеристики. Забележително е, че Batledantevirus 2 показва най-близка филогенетична връзка с известния вирус Le Dantec, който заразява хората.
Последващите серологични изследвания допълнително потвърдиха това откритие, тъй като неутрализиращи антитела срещу Batledantevirus 2 бяха открити в 2,8% от серумите на местните жители. Този резултат предполага, че в човешката популация може вече да са се появили неразпознати или асимптоматични инфекции, което подчертава потенциален, но неоткрит досега зоонотичен път на предаване.
3. Динамика на междувидово предаване
Анализът на междувидовото предаване показа, че гризачите заемат централно място в мрежата за споделяне на вируси, действайки като ключови възли, които улесняват вирусния обмен между видовете гостоприемници. Общо 15 вируса бяха идентифицирани като имащи потенциал за междувидово предаване.
По-нататъшен анализ на моделите на междуредово предаване показа, че споделянето на вируса се случва по-често между гостоприемници в рамките на един и същ таксономичен ред, което предполага, че родствената връзка на гостоприемника играе важна роля в динамиката на предаването. За разлика от това, прилепите показват относително по-нисък капацитет за междуредово предаване.
Важно е да се отбележи, че при някои вируси са наблюдавани доказателства за разширяване на обхвата на гостоприемника. Например, вирусът Melian, който преди това е бил считан за специфичен за землеровките, е открит и при гризачи в това проучване, което показва потенциална промяна в адаптивността на гостоприемника и повишен риск от по-широко разпространение.
Заключения и последици за общественото здраве
- Високо виромно разнообразие при дивите дребни бозайници:Откриването на 39 РНК вируса, включително 26 нови вида, разкрива голям вирусен резервоар в региона и за първи път съобщава за нови вируси с висок зоонотичен потенциал (напр. Bat ledantevirus 2).
- Гризачите като приоритетни цели за наблюдение:Гризачите действат като ключови центрове за предаване на вируса и носят най-голямо вирусно разнообразие, което представлява най-голям риск от разпространение.
- Необходимост от интегрирани стратегии за наблюдение:Констатациите подкрепят приоритизирането на гризачите в програмите за активно наблюдение и прилагането на интегрирани подходи, комбиниращи метагеномика, серология и екологичен мониторинг на границите между човек и дива природа.
Като цяло, това проучване предоставя важни доказателства в подкрепа на системите за ранно предупреждение и рамките за оценка на риска за нововъзникващи зоонозни заболявания, като по този начин засилва значението на проактивното наблюдение в регионите с висок риск.
Информация за продукта
Време на публикуване: 23 март 2026 г.