Ново оръжие за диагностика на туберкулоза и откриване на резистентност към лекарства: Ново поколение насочено към секвениране (TNGs), комбинирано с машинно обучение за туберкулоза с диагностика на свръхчувствителност
Доклад за литературата: CCA: Диагностичен модел, базиран на TNG и машинно обучение, който е подходящ за хора с по -малко бактериална туберкулоза и туберкулозен менингит.
Заглавие на тезата: Tuberculous-Targeted Секвениране от следващо поколение и машинно обучение: ултра чувствителна диагностична стратегия за паучични белодробни тръби и тръбен менингит.
Периодично: 《Clinica chimica acta》
Ако: 6.5
Дата на публикуване: януари 2024 г.
В комбинация с Университета на Китайската академия на науките и Пекинската гръдна болница на Capital Medical University, Macro & Micro-тест създаде модел за диагностика на туберкулоза, базиран на новото поколение технология на целенасочено секвениране (TNGs) и метод на машинно обучение, който предоставя ултра-висока технология Чувствителност към откриване при туберкулоза с малко бактерии и туберкулозен менингит, предостави нов метод за диагностика на свръхчувствителност за клинична диагноза на два вида Туберкулоза и помогна за точната диагноза, откриване на лекарствена резистентност и лечение на туберкулоза. В същото време се установява, че плазмената cfDNA на пациента може да се използва като подходящ тип проба за клинично вземане на проби при диагностицирането на TBM.
In this study, 227 plasma samples and cerebrospinal fluid samples were used to establish two clinical cohorts, in which the laboratory diagnostic cohort samples were used to establish the machine learning model of tuberculosis diagnosis, and the clinical diagnostic cohort samples were used to verify the established диагностичен модел. Всички проби са насочени първо от специално проектиран целеви сонда за улавяне на Mycobacterium tuberculosis. След това, въз основа на данните за секвениране на TB-TNGS, моделът на дървото на решенията се използва за извършване на 5-кратно кръстосано валидиране на наборите за обучение и валидиране на лабораторната диагностична опашка и се получават диагностични прагове на плазмени проби и проби от мозъчна течност. Полученият праг се въвежда в два тестови набора от опашка за клинична диагностика за откриване и диагностичната ефективност на обучаемия се оценява чрез ROC Curve. Накрая е получен диагностициран модел на туберкулоза.
Фиг. 1 Схематична диаграма на изследователския дизайн
Резултати: Според специфичните прагове на ДНК пробата на CSF (AUC = 0,974) и плазмената CFDNA проба (AUC = 0,908), определени в това проучване, сред 227 проби, чувствителността на CSF пробата е 97,01%, спецификата е 95,65%и Чувствителността и специфичността на плазмената проба са 82,61% и 86,36%. In the analysis of 44 paired samples of plasma cfDNA and cerebrospinal fluid DNA from TBM patients, the diagnostic strategy of this study has a high consistency of 90.91% (40/44) in plasma cfDNA and cerebrospinal fluid DNA, and the sensitivity is 95.45% (42/44). При деца с белодробна туберкулоза, диагностичната стратегия на това проучване е по -чувствителна към плазмените проби, отколкото резултатите от откриване на Xpert на проби от стомашен сок от същите пациенти (28,57% срещу 15,38%).
Фиг. 2 Анализ Ефектив на модел на диагностика на туберкулоза за проби от популация
